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1.

A Long Noncoding RNA lincRNA-EPS Acts as a Transcriptional Brake to Restrain Inflammation.

Atianand, Maninjay K; Hu, Wenqian; Satpathy, Ansuman T; Shen, Ying; Ricci, Emiliano P; Alvarez-Dominguez, Juan R; Bhatta, Ankit; Schattgen, Stefan A; McGowan, Jason D; Blin, Juliana; Braun, Joerg E; Gandhi, Pallavi; Moore, Melissa J; Chang, Howard Y; Lodish, Harvey F; Caffrey, Daniel R; Fitzgerald, Katherine A.

Cell ; 165(7): 1672-1685, 2016 Jun 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27315481

2.

Translation-dependent and -independent mRNA decay occur through mutually exclusive pathways defined by ribosome density during T cell activation.

Mercier, Blandine C; Labaronne, Emmanuel; Cluet, David; Guiguettaz, Laura; Fontrodona, Nicolas; Bicknell, Alicia; Corbin, Antoine; Wencker, Mélanie; Aube, Fabien; Modolo, Laurent; Jouravleva, Karina; Auboeuf, Didier; Moore, Melissa J; Ricci, Emiliano P.

Genome Res ; 34(3): 394-409, 2024 Apr 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38508694

3.

Loop extrusion as a mechanism for formation of DNA damage repair foci.

Arnould, Coline; Rocher, Vincent; Finoux, Anne-Laure; Clouaire, Thomas; Li, Kevin; Zhou, Felix; Caron, Pierre; Mangeot, Philippe E; Ricci, Emiliano P; Mourad, Raphaël; Haber, James E; Noordermeer, Daan; Legube, Gaëlle.

Nature ; 590(7847): 660-665, 2021 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33597753

4.

System-wide Profiling of RNA-Binding Proteins Uncovers Key Regulators of Virus Infection.

Garcia-Moreno, Manuel; Noerenberg, Marko; Ni, Shuai; Järvelin, Aino I; González-Almela, Esther; Lenz, Caroline E; Bach-Pages, Marcel; Cox, Victoria; Avolio, Rosario; Davis, Thomas; Hester, Svenja; Sohier, Thibault J M; Li, Bingnan; Heikel, Gregory; Michlewski, Gracjan; Sanz, Miguel A; Carrasco, Luis; Ricci, Emiliano P; Pelechano, Vicent; Davis, Ilan; Fischer, Bernd; Mohammed, Shabaz; Castello, Alfredo.

Mol Cell ; 74(1): 196-211.e11, 2019 04 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30799147

5.

A cohesin/HUSH- and LINC-dependent pathway controls ribosomal DNA double-strand break repair.

Marnef, Aline; Finoux, Anne-Laure; Arnould, Coline; Guillou, Emmanuelle; Daburon, Virginie; Rocher, Vincent; Mangeat, Thomas; Mangeot, Philippe E; Ricci, Emiliano P; Legube, Gaëlle.

Genes Dev ; 33(17-18): 1175-1190, 2019 09 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31395742

6.

The DEAD box RNA helicase DDX42 is an intrinsic inhibitor of positive-strand RNA viruses.

Bonaventure, Boris; Rebendenne, Antoine; Chaves Valadão, Ana Luiza; Arnaud-Arnould, Mary; Gracias, Ségolène; Garcia de Gracia, Francisco; McKellar, Joe; Labaronne, Emmanuel; Tauziet, Marine; Vivet-Boudou, Valérie; Bernard, Eric; Briant, Laurence; Gros, Nathalie; Djilli, Wassila; Courgnaud, Valérie; Parrinello, Hugues; Rialle, Stéphanie; Blaise, Mickaël; Lacroix, Laurent; Lavigne, Marc; Paillart, Jean-Christophe; Ricci, Emiliano P; Schulz, Reiner; Jouvenet, Nolwenn; Moncorgé, Olivier; Goujon, Caroline.

EMBO Rep ; 23(11): e54061, 2022 11 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36161446

7.

Senataxin homologue Sen1 is required for efficient termination of RNA polymerase III transcription.

Rivosecchi, Julieta; Larochelle, Marc; Teste, Camille; Grenier, Frédéric; Malapert, Amélie; Ricci, Emiliano P; Bernard, Pascal; Bachand, François; Vanoosthuyse, Vincent.

EMBO J ; 38(16): e101955, 2019 08 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31294478

8.

Pseudomonas aeruginosa cleaves the decoding center of Caenorhabditis elegans ribosomes.

Vasquez-Rifo, Alejandro; Ricci, Emiliano P; Ambros, Victor.

PLoS Biol ; 18(12): e3000969, 2020 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33259473

9.

PDZ domain-binding motif of Tax sustains T-cell proliferation in HTLV-1-infected humanized mice.

Pérès, Eléonore; Blin, Juliana; Ricci, Emiliano P; Artesi, Maria; Hahaut, Vincent; Van den Broeke, Anne; Corbin, Antoine; Gazzolo, Louis; Ratner, Lee; Jalinot, Pierre; Duc Dodon, Madeleine.

PLoS Pathog ; 14(3): e1006933, 2018 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29566098

10.

microRNAs stimulate translation initiation mediated by HCV-like IRESes.

Mengardi, Chloé; Limousin, Taran; Ricci, Emiliano P; Soto-Rifo, Ricardo; Decimo, Didier; Ohlmann, Théophile.

Nucleic Acids Res ; 45(8): 4810-4824, 2017 05 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28077561

11.

When mRNA translation meets decay.

Bicknell, Alicia A; Ricci, Emiliano P.

Biochem Soc Trans ; 45(2): 339-351, 2017 04 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28408474

12.

An optimized kit-free method for making strand-specific deep sequencing libraries from RNA fragments.

Heyer, Erin E; Ozadam, Hakan; Ricci, Emiliano P; Cenik, Can; Moore, Melissa J.

Nucleic Acids Res ; 43(1): e2, 2015 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25505164

13.

HIV-2 genomic RNA accumulates in stress granules in the absence of active translation.

Soto-Rifo, Ricardo; Valiente-Echeverria, Fernando; Rubilar, Paulina S; Garcia-de-Gracia, Francisco; Ricci, Emiliano P; Limousin, Taran; Décimo, Didier; Mouland, Andrew J; Ohlmann, Théophile.

Nucleic Acids Res ; 42(20): 12861-75, 2014 Nov 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25352557

14.

RIPiT-Seq: a high-throughput approach for footprinting RNA:protein complexes.

Singh, Guramrit; Ricci, Emiliano P; Moore, Melissa J.

Methods ; 65(3): 320-32, 2014 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24096052

15.

miRNA repression of translation in vitro takes place during 43S ribosomal scanning.

Ricci, Emiliano P; Limousin, Taran; Soto-Rifo, Ricardo; Rubilar, Paulina S; Decimo, Didier; Ohlmann, Théophile.

Nucleic Acids Res ; 41(1): 586-98, 2013 Jan 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23161679

16.

Different effects of the TAR structure on HIV-1 and HIV-2 genomic RNA translation.

Soto-Rifo, Ricardo; Limousin, Taran; Rubilar, Paulina S; Ricci, Emiliano P; Décimo, Didier; Moncorgé, Olivier; Trabaud, Mary-Anne; André, Patrice; Cimarelli, Andrea; Ohlmann, Théophile.

Nucleic Acids Res ; 40(6): 2653-67, 2012 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22121214

17.

Metabolism-dependent secondary effect of anti-MAPK cancer therapy on DNA repair.

Aubé, Fabien; Fontrodona, Nicolas; Guiguettaz, Laura; Vallin, Elodie; Fabbri, Lucilla; Lapendry, Audrey; Vagner, Stephan; Ricci, Emiliano P; Auboeuf, Didier.

NAR Cancer ; 6(2): zcae019, 2024 Jun.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38690580

18.

Stable structures or PABP1 loading protects cellular and viral RNAs against ISG20-mediated decay.

Louvat, Camille; Deymier, Séverine; Nguyen, Xuan-Nhi; Labaronne, Emmanuel; Noy, Kodie; Cariou, Marie; Corbin, Antoine; Mateo, Mathieu; Ricci, Emiliano P; Fiorini, Francesca; Cimarelli, Andrea.

Life Sci Alliance ; 7(5)2024 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38418089

19.

The Andes hantavirus NSs protein is expressed from the viral small mRNA by a leaky scanning mechanism.

Vera-Otarola, Jorge; Solis, Loretto; Soto-Rifo, Ricardo; Ricci, Emiliano P; Pino, Karla; Tischler, Nicole D; Ohlmann, Théophile; Darlix, Jean-Luc; López-Lastra, Marcelo.

J Virol ; 86(4): 2176-87, 2012 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22156529

20.

Activation of a microRNA response in trans reveals a new role for poly(A) in translational repression.

Ricci, Emiliano P; Limousin, Taran; Soto-Rifo, Ricardo; Allison, Rachel; Pöyry, Tuija; Decimo, Didier; Jackson, Richard J; Ohlmann, Théophile.

Nucleic Acids Res ; 39(12): 5215-31, 2011 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21385827

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